Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms