Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERFP50548 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERFP50548 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERFP50548 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERFP50548 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERFP50548 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERFP50548 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms