Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTPAP49638 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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