Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM4P49221 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms