Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A2P43004 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms