Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP2P42575 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms