Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms