Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms