Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRABP1P29762 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms