Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
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