Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms