Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB2P26583 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms