Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms