Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMA3P25788 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms