Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFSF4P23510 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms