Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CA6P23280 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CA6P23280 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CA6P23280 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms