Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA6P23229 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms