Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BGNP21810 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BGNP21810 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BGNP21810 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BGNP21810 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms