Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPI1P17947 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms