Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZKSCAN1P17029 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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