Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms