Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CREB1P16220 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CREB1P16220 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms