Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSP16219 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSP16219 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSP16219 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSP16219 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms