Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD46P15529 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD46P15529 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD46P15529 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD46P15529 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD46P15529 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD46P15529 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD46P15529 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD46P15529 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD46P15529 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD46P15529 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms