Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms