Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms