Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms