Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA1P02647 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms