Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-HP01893 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms