Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms