Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms