Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRMUO75648 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRMUO75648 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRMUO75648 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms