Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PITX3O75364 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PITX3O75364 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms