Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms