Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC3O60481 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms