Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms