Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVH48-1M5A8F1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVH48-1M5A8F1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms