Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOC4-APOC2K7ER74 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms