Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms