Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms