Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DXG7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DXG7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DXG7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DXG7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DXG7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DXG7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DXG7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DXG7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms