Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms