Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms