Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XIRP2A4UGR9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XIRP2A4UGR9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms