Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms