Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVW-1Q9UQF0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms