Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN3Q9UPQ7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms