Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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