Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms