Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms